NET Scripting Backend は、スクリプトの処理に Microsofts .NET を使用しています。他の Unity プラットフォームと異なり、Windows ストアは .NET 3.5 Class Libraries プロファイルではなく .NET 4.5. のサブセットを使用しています。これは、Windows ストアの認可条件を満たすためです。したがって、他のプラットフォームに対して一部非互換性が生じます。例えば、プラグインの型が異なったり、Unity が通常使用する .NET 3.5 プロファイルに含まれるタイプの一部が欠落していたりします。